RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.37■□□□□ 0.05
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PTPRU-204ENST00000428026 DRP2Q13474 957 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 38.8
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PTPRU-204ENST00000428026 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.35■□□□□ 0.05
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PTPRU-204ENST00000428026 USP17L18D6R9N7 530 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 USP17L22D6RA61 530 aa15.35■□□□□ 0.05
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PTPRU-204ENST00000428026 USP17L19D6RCP7 530 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 USP17L20D6RJB6 530 aa15.35■□□□□ 0.05
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PTPRU-204ENST00000428026 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.35■□□□□ 0.05
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PTPRU-204ENST00000428026 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 THAP11Q96EK4 314 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 AURKCQ9UQB9 309 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
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PTPRU-204ENST00000428026 POTEIP0CG38 1075 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CNGA3Q16281 694 aa15.34■□□□□ 0.05
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