RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CHPFQ8IZ52 775 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 OR7D4Q8NG98 312 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 MDM1Q8TC05 714 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 EPC1Q9H2F5 836 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 LDAHQ9H6V9 325 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 BCO1Q9HAY6 547 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 IPPQ9Y573 584 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 ZMYM3Q14202 1370 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 B8ZZF3 427 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PRRG2O14669 202 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 GASTP01350 101 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CRHR1P34998 444 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 WASP42768 502 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 SLC6A9P48067 706 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CTSWP56202 376 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 APBA1Q02410 837 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 FOXL1Q12952 345 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 IL10RAQ13651 578 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 RAB24Q969Q5 203 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 HDAC10Q969S8 669 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 IL17RAQ96F46 866 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 LRGUKQ96M69 825 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 TSPAN6O43657 245 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 RFPL1O75677 317 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 RAD17O75943 681 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 ITGB3P05106 788 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 POU2F2P09086 479 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 VCAM1P19320 739 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PDCP20941 246 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 SREBF1P36956 1147 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 GZMKP49863 264 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PLP2Q04941 152 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 STON2Q8WXE9 905 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 KAT5Q92993 513 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 MSL2Q9HCI7 577 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 WNT10BO00744 389 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 SYN1P17600 705 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CYP2C19P33261 490 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 ICAM4Q14773 271 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 D2HGDHQ8N465 521 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CEP95Q96GE4 821 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 LOXL4Q96JB6 756 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 LANCL2Q9NS86 450 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 TDP1Q9NUW8 608 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PATE3B3GLJ2 98 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 AP1G1O43747 822 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 AMY1AP04745 511 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 FPR1P21462 350 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 AKAP5P24588 427 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 USP45Q70EL2 814 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 XYLT1Q86Y38 959 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms