RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.89■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.89■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PPME1Q9Y570 386 aa15.89■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ACACBO00763 2458 aa15.89■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 POTEMA6NI47 508 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 DEXIO95424 95 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 SP9P0CG40 484 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 EMC2Q15006 297 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 EPHA7Q15375 998 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 GPR65Q8IYL9 337 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 RABGGTAQ92696 567 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 CSRNP2Q9H175 543 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.136e-7■□□□□ 8.6
NFE4-201ENST00000420058 FNIP2Q9P278 1114 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 FANCMQ8IYD8 2048 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 LRRN2O75325 713 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 SLITRK3O94933 977 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 AXLP30530 894 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 YWHABP31946 246 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 SPECC1Q5M775 1068 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 GALNT17Q6IS24 598 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 EXOC8Q8IYI6 725 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 DCLK2Q8N568 766 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 DYDC2Q96IM9 177 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 LXNQ9BS40 222 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 DPP7Q9UHL4 492 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.87■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ZMYND10O75800 440 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 AKAP5P24588 427 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ARL2P36404 184 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 STARD6P59095 220 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 GPC5P78333 572 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 POU5F1BQ06416 359 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 USP41Q3LFD5 358 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 XKR9Q5GH70 373 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 FUT10Q6P4F1 479 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 NOTUMQ6P988 496 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 RUFY3Q7L099 469 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 OXER1Q8TDS5 423 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 TCP11Q8WWU5 503 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 FGF14Q92915 247 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 CCDC51Q96ER9 411 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 COLEC11Q9BWP8 271 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 FOXQ1Q9C009 403 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ARHGEF3Q9NR81 526 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.86■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 B4GALT5O43286 388 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 DTNBO60941 627 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PSMA5P28066 241 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 CAPSQ13938 189 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 RTP2Q5QGT7 225 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PARM1Q6UWI2 310 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 HSD17B14Q9BPX1 270 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.85■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 TBX3O15119 743 aa15.84■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 ERLIN2O94905 339 aa15.84■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 NTHL1P78549 312 aa15.84■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 CYP4A11Q02928 519 aa15.84■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
NFE4-201ENST00000420058 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms