RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 MAGEB2O15479 319 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 ASAP2O43150 1006 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 CA12O43570 354 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 LGALS2P05162 132 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 TNNT1P13805 278 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 GARTP22102 1010 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 GLRA2P23416 452 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 LIG4P49917 911 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 VAMP7P51809 220 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 KRT83P78385 493 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 CDK17Q00537 523 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 TNFAIP2Q03169 654 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 ENPEPQ07075 957 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 KCNMA1Q12791 1236 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 BFSP1Q12934 665 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 TFDP1Q14186 410 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 MEA1Q16626 185 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 PTPRNQ16849 979 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 RRAGAQ7L523 313 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM50Q86XT4 487 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 PRR7Q8TB68 274 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 AFG1LQ8WV93 481 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 KCNN1Q92952 543 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 BORCS6Q96GS4 357 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC42Q96M95 316 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 CEP89Q96ST8 783 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 APBA2Q99767 749 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 KATNBL1Q9H079 304 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HDAC8-211ENST00000415409 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 USP27XA6NNY8 438 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TISP43B9A030 160 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 P4HA2O15460 535 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ADCY3O60266 1144 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 NDUFA10O95299 355 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PIGRP01833 764 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 BMP1P13497 986 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CYP2B6P20813 491 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PON1P27169 355 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TMOD1P28289 359 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 FMO5P49326 533 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 VEGFBP49765 207 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 FCGRTP55899 365 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SH3BP2P78314 561 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MYL7Q01449 175 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 NOGQ13253 232 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 GRM1Q13255 1194 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CRHR2Q13324 411 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CAPSQ13938 189 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MTF1Q14872 753 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SPA17Q15506 151 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 DGKDQ16760 1214 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PDXDC1Q6P996 788 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 USP6NLQ92738 828 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.21□□□□□ -1.26
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