RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 CLUL1Q15846 466 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 MORC4Q8TE76 937 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 PCYT2Q99447 389 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 MED4Q9NPJ6 270 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 KCNK3O14649 394 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 RTN2O75298 545 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 MTA2O94776 668 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 STAT5BP51692 787 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 MOGSQ13724 837 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SV2AQ7L0J3 742 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 DEPTORQ8TB45 409 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SEMA4DQ92854 862 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 MROH8Q9H579 483 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 AMFRQ9UKV5 643 aa21.78■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC188H7C350 402 aa21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 LGR5O75473 907 aa21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 EMBQ6PCB8 327 aa21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 DAAM2Q86T65 1068 aa21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 MS4A14Q96JA4 679 aa21.77■■□□□ 1.08
SUMO3-204ENST00000411651 EPHB4P54760 987 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 NNTQ13423 1086 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SCFD2Q8WU76 684 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.075e-8■□□□□ 8.8
SUMO3-204ENST00000411651 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 K7ERI5 159 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SLC26A2P50443 739 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 DMTNQ08495 405 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 IFT20Q8IY31 132 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 GDF3Q9NR23 364 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 EHD2Q9NZN4 543 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 GGPS1O95749 300 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 EFNA5P52803 228 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ZACNQ401N2 412 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 DLK2Q6UY11 383 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ZPBP2Q6X784 338 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 METTL13Q8N6R0 699 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 FGD4Q96M96 766 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 AZI2Q9H6S1 392 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.75■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ADCY3O60266 1144 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 EPHX2P34913 555 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 GPC5P78333 572 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 KCTD2Q14681 263 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 TCP11Q8WWU5 503 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CAVIN3Q969G5 261 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM143Q96AN5 459 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 THAP2Q9H0W7 228 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CARD9Q9H257 536 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SOCS7O14512 581 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CHRNB2P17787 502 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PDE6CP51160 858 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 CDR2Q01850 454 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 IER5Q5VY09 327 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF677Q86XU0 584 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PALB2Q86YC2 1186 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 FAM71BQ8TC56 605 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 FNBP1Q96RU3 617 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 SYT17Q9BSW7 474 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.74■■□□□ 1.07
SUMO3-204ENST00000411651 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.73■■□□□ 1.07
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