RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 TRPC7Q9HCX4 862 aa26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 SNX19Q92543 992 aa26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 PARD6BQ9BYG5 372 aa26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC38A7Q9NVC3 462 aa26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 SUN2Q9UH99 717 aa26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 CCDC151A5D8V7 595 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 KLHL38Q2WGJ6 581 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 XRRA1Q6P2D8 792 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 UPP2O95045 317 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 ITGA4P13612 1032 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 EXOC4Q96A65 974 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 SNX9Q9Y5X1 595 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF609O15014 1411 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 ALDH1A1P00352 501 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 EMBQ6PCB8 327 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 ANO9A1A5B4 782 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 TECPR2O15040 1411 aa26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 CD4P01730 458 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 HSD17B4P51659 736 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 PRKCEQ02156 737 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 CRLF3Q8IUI8 442 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 MAML1Q92585 1016 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 EPAS1Q99814 870 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 ERAP1Q9NZ08 941 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 DIP2AQ14689 1571 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 KPNA7A9QM74 516 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 DFFAO00273 331 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 TRIM68Q6AZZ1 485 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 E9PCH4 1651 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 KIF19Q2TAC6 998 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 DRC3Q9H069 523 aa26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 GOLGA8MH3BSY2 632 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 MX2P20592 715 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 CDR2Q01850 454 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 SNX17Q15036 470 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 BFARQ9NZS9 450 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 PRAMEP78395 509 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 IFT88Q13099 833 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 EHD2Q9NZN4 543 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 CYP2C9P11712 490 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 EFHBQ8N7U6 833 aa26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1-202ENST00000409402 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 CDH6P55285 790 aa26.58■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 GLB1LQ6UWU2 654 aa26.58■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 SULT1E1P49888 294 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 ACOT2P49753 483 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 RNF180Q86T96 592 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 GIPC2Q8TF65 315 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 ULK4Q96C45 1275 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 AGPAT1Q99943 283 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 HBP1O60381 514 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 LAMC2Q13753 1193 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 GLYCTKQ8IVS8 523 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 APOL1O14791 398 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 TMCC1O94876 653 aa26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 IL18RAPO95256 599 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC8A1P32418 973 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 TMEM62Q0P6H9 643 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 ATG4CQ96DT6 458 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 VPS11Q9H270 941 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 A0A1W2PQC6 194 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 SRGAP2O75044 1071 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 GNASQ5JWF2 1037 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 TAS2R42Q7RTR8 314 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 SERPINI1Q99574 410 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 RIT2Q99578 217 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 REEP2Q9BRK0 252 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 TRIM9Q9C026 710 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 TXLNGQ9NUQ3 528 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 PI4K2BG5E9Z4 385 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 TMPRSS15P98073 1019 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 CYP26A1O43174 497 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 TTC17Q96AE7 1141 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 RMDN1Q96DB5 314 aa26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1-202ENST00000409402 NR1D1P20393 614 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms