RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.52■□□□□ 0.88
USP39-202ENST00000409025 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP39-202ENST00000409025 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP39-202ENST00000409025 NENFQ9UMX5 172 aa20.52■□□□□ 0.88
USP39-202ENST00000409025 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.879e-13■■■■□ 21.9
USP39-202ENST00000409025 LGALS2P05162 132 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 MFAP3P55082 362 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ZPBP2Q6X784 338 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 SV2AQ7L0J3 742 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 SEMA4DQ92854 862 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 FNBP1Q96RU3 617 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 RAB20Q9NX57 234 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 A0A0B4J269 797 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CTAGE8P0CG41 777 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 TFDP1Q14186 410 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CHADLQ6NUI6 762 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 RNF149Q8NC42 400 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 RABGGTAQ92696 567 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 NT5C1BQ96P26 610 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.51■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 TNFAIP3P21580 790 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ACOT2P49753 483 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CLDN10P78369 228 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 AFG1LQ8WV93 481 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 TINF2Q9BSI4 451 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 INTUQ9ULD6 942 aa20.5■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 EDN1P05305 212 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 H2AFZP0C0S5 128 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 MAPK6Q16659 721 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 H2AFVQ71UI9 128 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 SYT11Q9BT88 431 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CPA4Q9UI42 421 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 SNX12Q9UMY4 172 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 MYH10P35580 1976 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CLDN3O15551 220 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ASAP2O43150 1006 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 MSCO60682 206 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 SRGAP2O75044 1071 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 PRKCBP05771 671 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 PRLRP16471 622 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 TNNI1P19237 187 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 METTL13Q8N6R0 699 aa20.49■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 PPFIA4O75335 1185 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 TOM1L1O75674 476 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 INSRRP14616 1297 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ACVR2BQ13705 512 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ZNF516Q92618 1163 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 KAT5Q92993 513 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 AGPAT1Q99943 283 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.879e-9■■■■■ 111.8
USP39-202ENST00000409025 TSKSQ9UJT2 592 aa20.48■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 C22orf31O95567 290 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 USP8P40818 1118 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 IGBP1P78318 339 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 HELQQ8TDG4 1101 aa20.47■□□□□ 0.87
USP39-202ENST00000409025 FAM81BQ96LP2 452 aa20.47■□□□□ 0.87
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