RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 KCNMA1Q12791 1236 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 AMHR2Q16671 573 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 SEZ6Q53EL9 994 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 GBP6Q6ZN66 633 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 RSPH3Q86UC2 560 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 SESTD1Q86VW0 696 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CNGA4Q8IV77 575 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 GRIN2DO15399 1336 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 KBTBD13C9JR72 458 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 M0QZ92 97 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 NRDCO43847 1150 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 MFAP3LO75121 409 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 MYL7Q01449 175 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 MCL1Q07820 350 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 PTGISQ16647 500 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TC2NQ8N9U0 490 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 NOD1Q9Y239 953 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TTC26A0AVF1 554 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 STX10O60499 249 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TSPAN1O60635 241 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 PROZP22891 400 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 GCLMP48507 274 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 MTFR1Q15390 333 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TMC2Q8TDI7 906 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 IQCDQ96DY2 449 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 GCNT4Q9P109 453 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ABLIM1O14639 778 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 OGTO15294 1046 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CCL5P13501 91 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CBWD6Q4V339 395 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 SERINC5Q86VE9 423 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 DEFB118Q96PH6 123 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 FNBP1Q96RU3 617 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 RNF208Q9H0X6 261 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1W2PQY0 241 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 SLC9A1P19634 815 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 KRT9P35527 623 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PPP3CAQ08209 521 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 SNX17Q15036 470 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 FIGNQ5HY92 759 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CDT1Q9H211 546 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 EPHB6O15197 1021 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 SKILP12757 684 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 TNFSF9P41273 254 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 OSTNP61366 133 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CETN1Q12798 172 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PSMD6Q15008 389 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CTSHP09668 335 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 MXI1P50539 228 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CCZ1BP86790 482 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 APBA1Q02410 837 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms