RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 HELQQ8TDG4 1101 aa32.97■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 CASD1Q96PB1 797 aa32.97■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 ACCSQ96QU6 501 aa32.97■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 HAPLN2Q9GZV7 340 aa32.97■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa32.97■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 CHD7Q9P2D1 2997 aa32.97■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 HOXA2O43364 376 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 ITGA4P13612 1032 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM117Q9H0C3 514 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 TBKBP1A7MCY6 615 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD63C9JTQ0 380 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 GOLGA6L22H0YM25 854 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 RHOBTB3O94955 611 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 PSMD2Q13200 908 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF507Q8TCN5 953 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 APOL6Q9BWW8 343 aa32.96■■■□□ 2.87
PKDCC-202ENST00000401498 LINC01553A4QN01 128 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 TISP43B9A030 160 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 CLDN3O15551 220 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 OFD1O75665 1012 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 MCF2P10911 925 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 AKAP5P24588 427 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 HOXD13P35453 343 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.86
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PKDCC-202ENST00000401498 CEP120Q8N960 986 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA0895Q8NCT3 520 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 SCFD1Q8WVM8 642 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 RSAD1Q9HA92 442 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 SLC28A3Q9HAS3 691 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 SNTG2Q9NY99 539 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 CDH23Q9H251 3354 aa32.95■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 TAP1Q03518 808 aa32.94■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 MCL1Q07820 350 aa32.94■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 KCNB1Q14721 858 aa32.94■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP32.94■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA20Q8TB22 786 aa32.94■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 EXOC7Q9UPT5 735 aa32.94■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa32.94■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 SPRED2Q7Z698 418 aa32.93■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 HACE1Q8IYU2 909 aa32.93■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 ABI1Q8IZP0 508 aa32.93■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM206Q9H813 350 aa32.93■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 UBN1Q9NPG3 1134 aa32.93■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 HARSP12081 509 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 PPP2R2DQ66LE6 453 aa32.92■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 GLB1LQ6UWU2 654 aa32.92■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 FIBCD1Q8N539 461 aa32.92■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
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PKDCC-202ENST00000401498 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP32.92■■■□□ 2.86
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PKDCC-202ENST00000401498 TMEM192Q8IY95 271 aa32.92■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 SYCP3Q8IZU3 236 aa32.92■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 PARP2Q9UGN5 583 aa32.92■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 GIT1Q9Y2X7 761 aa32.92■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 A0A0B4J269 797 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 LINC00271P0C7V0 271 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 ADSSP30520 456 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 GRM5P41594 1212 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 BMT2Q1RMZ1 405 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 THNSL1Q8IYQ7 743 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 GSDMAQ96QA5 445 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 GAD1Q99259 594 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 HCSTQ9UBK5 93 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 GDAQ9Y2T3 454 aa32.91■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA1671Q9BY89 1806 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 NLRC5Q86WI3 1866 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 SMC2O95347 1197 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 MLH1P40692 756 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 OSTNP61366 133 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 NOMO2Q5JPE7 1267 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 GPT2Q8TD30 523 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 SMARCE1Q969G3 411 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 ZFP42Q96MM3 310 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 KLK14Q9P0G3 267 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 UBE4BO95155 1302 aa32.9■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 TRIP11Q15643 1979 aa32.89■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 ARL5CA6NH57 179 aa32.89■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 INPPL1O15357 1258 aa32.89■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 RECQL4O94761 1208 aa32.89■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 CAMK4Q16566 473 aa32.89■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 SEZ6Q53EL9 994 aa32.89■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 GPR153Q6NV75 609 aa32.89■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 NELFCDQ8IXH7 590 aa32.89■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 GSTCDQ8NEC7 633 aa32.89■■■□□ 2.86
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF576Q9H609 170 aa32.89■■■□□ 2.86
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