RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 B4GALT5O43286 388 aa22.08■■□□□ 1.13
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HDDC3-202ENST00000394272 MCL1Q07820 350 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 MEA1Q16626 185 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 WDR59Q6PJI9 974 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 NLRP7Q8WX94 980 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 SIX2Q9NPC8 291 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 KCND1Q9NSA2 647 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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HDDC3-202ENST00000394272 ACTN1P12814 892 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 ACOT2P49753 483 aa22.07■■□□□ 1.12
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HDDC3-202ENST00000394272 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 C7orf31Q8N865 590 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 GPR32O75388 356 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 GNAT1P11488 350 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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HDDC3-202ENST00000394272 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 USP37Q86T82 979 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.06■■□□□ 1.12
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HDDC3-202ENST00000394272 CLDN10P78369 228 aa22.06■■□□□ 1.12
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HDDC3-202ENST00000394272 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.06■■□□□ 1.12
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HDDC3-202ENST00000394272 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 CHP1Q99653 195 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 TCHPQ9BT92 498 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC53A6NM62 1247 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 WNT7BP56706 349 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 EPC2Q52LR7 807 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.05■■□□□ 1.12
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HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB33Q86T24 672 aa22.05■■□□□ 1.12
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HDDC3-202ENST00000394272 OGTO15294 1046 aa22.04■■□□□ 1.12
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HDDC3-202ENST00000394272 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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HDDC3-202ENST00000394272 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 GRK4P32298 578 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 CETN1Q12798 172 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 KRT39Q6A163 491 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-202ENST00000394272 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.03■■□□□ 1.12
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