RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPM1AP35813 382 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT85P78386 507 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 SNTG2Q9NY99 539 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPG21Q9NZD8 308 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJB4Q9UDY4 337 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 H0YCG3 227 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAK2O60296 914 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCNN1GP51170 649 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 RESP18Q5W5W9 173 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 GBP3Q9H0R5 595 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDT1Q9H211 546 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLK14Q9P0G3 267 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 PARP2Q9UGN5 583 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 LZTS1Q9Y250 596 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 RECQL4O94761 1208 aa24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 CSPG5O95196 566 aa24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC11A1P49279 550 aa24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 DSC1Q08554 894 aa24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 STRN3Q13033 797 aa24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 K7ENM7 598 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERVFC1P60507 584 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZPBP2Q6X784 338 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 SFR1Q86XK3 245 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 CEP120Q8N960 986 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 DHX58Q96C10 678 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPATA32Q96LK8 384 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 CUEDC2Q9H467 287 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 TLR9Q9NR96 1032 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 CARNS1A5YM72 827 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 FSCN2O14926 492 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCP2P22307 547 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 IQUBQ8NA54 791 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGSF21Q96ID5 467 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNMDQ9H2S6 317 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 THEGQ9P2T0 379 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBX20Q9UMR3 447 aa24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 TOM1L1O75674 476 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 PIGRP01833 764 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 MCF2P10911 925 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRM5P41594 1212 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 NUCB2P80303 420 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 GTF2BQ00403 316 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT17Q04695 432 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 COL19A1Q14993 1142 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBTB33Q86T24 672 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 STAMQ92783 540 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 GDAQ9Y2T3 454 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 BRWD1Q9NSI6 2320 aa24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTGESO14684 152 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 HYAL1Q12794 435 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRIK3Q13003 919 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADALQ6DHV7 355 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM169Q96HH4 297 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCHHQ07283 1943 aa24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 REV3LO60673 3130 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 NRP1O14786 923 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP1R37O75864 691 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALDH2P05091 517 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 GAP43P17677 238 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.13■■□□□ 1.45
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