RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 ADRB2P07550 413 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC172P0C7W6 258 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 TMOD1P28289 359 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF26Q96DR7 871 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 FMO2Q99518 471 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 TXLNGYQ9BZA5 131 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.73■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 TNFAIP3P21580 790 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 ADSSP30520 456 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 CLUL1Q15846 466 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT71Q3SY84 523 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 C5orf60A6NFR6 353 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 P4HA2O15460 535 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 DCAF12L1Q5VU92 463 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 PNMA2Q9UL42 364 aa25.72■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPK13O15264 365 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 NR3C2P08235 984 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 FDX1P10109 184 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRAP18433 802 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC121Q6ZUS5 278 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 KAT5Q92993 513 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 AGPAT1Q99943 283 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM51Q9BSJ1 452 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 THAP2Q9H0W7 228 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 NPTX2P47972 431 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 SMTNP53814 917 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 DR1Q01658 176 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 RAPGEF5Q92565 580 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 TBX20Q9UMR3 447 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 NR2E1Q9Y466 385 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-201ENST00000369862 RGS20O76081 388 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 CCND2P30279 289 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 HMGCS2P54868 508 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 SOX10P56693 466 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 CETN1Q12798 172 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 DUPD1Q68J44 220 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 BSNDQ8WZ55 320 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 TLCD1Q96CP7 247 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 WRNIP1Q96S55 665 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.7■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC169A6NNP5 214 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF862O60290 1169 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 CDR1P51861 262 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 DCAF15Q66K64 600 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 ERP44Q9BS26 406 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM187AA6NFU0 413 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 MXI1P50539 228 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 NLRX1Q86UT6 975 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 GPRASP2Q96D09 838 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 IWS1Q96ST2 819 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 COG5Q9UP83 839 aa25.69■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD62A6NC57 917 aa25.68■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 QPCTQ16769 361 aa25.68■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 HOOK3Q86VS8 718 aa25.68■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.68■■□□□ 1.7
AMIGO1-201ENST00000369862 SAAL1Q96ER3 474 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms