RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 WDR26Q9H7D7 661 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 MARCH11A6NNE9 402 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 HLA-DOAP06340 250 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 SPATA31D3P0C874 917 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 RBP3P10745 1247 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 LSP1P33241 339 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 OCRLQ01968 901 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 GUCY1B3Q02153 619 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ADAM2Q99965 735 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 SPON1Q9HCB6 807 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 PRSS50Q9UI38 385 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 KAT6AQ92794 2004 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 NEK4P51957 841 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 PPARAQ07869 468 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 FOXI1Q12951 378 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 TCEA2Q15560 299 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 CAVIN3Q969G5 261 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 TEX101Q9BY14 249 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 INSL6Q9Y581 213 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ZMYM3Q14202 1370 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF185O15231 689 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 TERF2Q15554 542 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 DDB1Q16531 1140 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 BMT2Q1RMZ1 405 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 METRNLQ641Q3 311 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 ANKS6Q68DC2 871 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 SNX33Q8WV41 574 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 SLC9A6Q92581 669 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-202ENST00000368205 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM127O75204 238 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 ITGA10O75578 1167 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 GASTP01350 101 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 LSSP48449 732 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 TFAP2CQ92754 450 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 NELL1Q92832 810 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 LCHNA4D1U4 455 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 PRAMEF4O60810 478 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 ESRRBO95718 433 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 TP53BP2Q13625 1128 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 ASB10Q8WXI3 467 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 NINJ1Q92982 152 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 POGKQ9P215 609 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 UNC119BA6NIH7 251 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 SPDEFO95238 335 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 CXCR5P32302 372 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 CRHR1P34998 444 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 SCNN1BP51168 640 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 ZFP28Q8NHY6 868 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRK-202ENST00000368205 KCNG1Q9UIX4 513 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms