RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365359.1

RNU6-1138P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1138, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1138P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SPDEFO95238 335 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TYRP1P17643 537 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FBLP22087 321 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 XPAP23025 273 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ADCYAP1R1P41586 468 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CHN2P52757 468 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SEC24CP53992 1094 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 USP14P54578 494 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MANFP55145 182 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RAP2BP61225 183 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RESTQ13127 1097 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CCDC144BQ3MJ40 725 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PITRM1Q5JRX3 1037 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SOGA3Q5TF21 947 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FBXO42Q6P3S6 717 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LMBR1LQ6UX01 489 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DOK3Q7L591 496 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LRRTM3Q86VH5 581 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GLCCI1Q86VQ1 547 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ARHGEF19Q8IW93 802 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZZZ3Q8IYH5 903 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC44A3Q8N4M1 653 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SMC1BQ8NDV3 1235 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TFAP2CQ92754 450 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CAVIN3Q969G5 261 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZSWIM1Q9BR11 485 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PDCD2LQ9BRP1 358 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM260Q9NX78 707 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DKK2Q9UBU2 259 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PRSS50Q9UI38 385 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MAFGO15525 162 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KDM1AO60341 852 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RFPL3O75679 317 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ELANEP08246 267 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ITGAMP11215 1152 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LGALS4P56470 323 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 WNT3AP56704 352 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IL2P60568 153 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GUCY1B3Q02153 619 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PDCD1Q15116 288 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TERF2Q15554 542 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NFE2L2Q16236 605 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BROXQ5VW32 411 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PASD1Q8IV76 773 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF610Q8N9Z0 462 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SIMC1Q8NDZ2 872 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LINC00476Q8WZB0 136 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ORAI3Q9BRQ5 295 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KCTD10Q9H3F6 313 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FANCLQ9NW38 375 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GPRC5DQ9NZD1 345 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AATKQ6ZMQ8 1374 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PIPSLA2A3N6 862 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DRGXA6NNA5 263 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TBKBP1A7MCY6 615 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PRSS23O95084 383 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FKBP9O95302 570 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CTSSP25774 331 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CXCR5P32302 372 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LSP1P33241 339 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PTPN7P35236 360 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MPLP40238 635 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ID4P47928 161 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NRG3P56975 720 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CDK17Q00537 523 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SCAPQ12770 1279 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 DDB1Q16531 1140 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BMT2Q1RMZ1 405 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PRR16Q569H4 304 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 METTL24Q5JXM2 366 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TSHZ3Q63HK5 1081 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IQSEC1Q6DN90 963 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 EFCAB12Q6NXP0 572 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SYCE2Q6PIF2 218 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FKBP9P1Q75LS8 142 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GPR149Q86SP6 731 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ARHGEF25Q86VW2 580 aa2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms