RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 HERVK_113Q902F9 699 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SAAL1Q96ER3 474 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K14Q99558 947 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PHF24Q9UPV7 400 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ALADP13716 330 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 USP28Q96RU2 1077 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 DYRK4Q9NR20 520 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 USP20Q9Y2K6 914 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.642e-8■■■■■ 71.8
PTPRC-201ENST00000348564 KIF13BQ9NQT8 1826 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 DLEC1Q9Y238 1755 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa4.79□□□□□ -1.64
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