RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 ABLIM1O14639 778 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 EXTL3O43909 919 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 CKBP12277 381 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 MAN2A1Q16706 1144 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 MAPK13O15264 365 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 RPS6KA5O75582 802 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TPM3P06753 285 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 AXLP30530 894 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 NR1I3Q14994 352 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 FAM228AQ86W67 206 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 CAGE1Q8TC20 777 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 ZNF233A6NK53 670 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 ACOT2P49753 483 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 OGTO15294 1046 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 KRT13P13646 458 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 VWA3BQ502W6 1294 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 MIIPQ5JXC2 388 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 NOTUMQ6P988 496 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 CDT1Q9H211 546 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 CITO14578 2027 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 ADRB2P07550 413 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 RBL2Q08999 1139 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 BFSP1Q12934 665 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 BFSP2Q13515 415 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TRIM60Q495X7 471 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TOX2Q96NM4 488 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 NDST4Q9H3R1 872 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 INTS13Q9NVM9 706 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 GPR182O15218 404 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TEX33O43247 280 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 MCF2P10911 925 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TLE2Q04725 743 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 SEZ6Q53EL9 994 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TRIP11Q15643 1979 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 LGALS16A8MUM7 142 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 FAM189A1O60320 539 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 GHRP10912 638 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 UBXN1Q04323 297 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 KCNH2Q12809 1159 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 SQORQ9Y6N5 450 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 ANK1P16157 1881 aa24.09■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 VAMP7P51809 220 aa24.08■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 CYP24A1Q07973 514 aa24.08■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 LPIN1Q14693 890 aa24.08■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 USP38Q8NB14 1042 aa24.08■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 SLC35C1Q96A29 364 aa24.08■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 SELPP16109 830 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 TNFSF9P41273 254 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 FAAP100Q0VG06 881 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CEP120Q8N960 986 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PADI3Q9ULW8 664 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.08■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PITPNM1O00562 1244 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 CD52P31358 61 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 OSTNP61366 133 aa24.07■■□□□ 1.44
CTU2-201ENST00000312060 PAK2Q13177 524 aa24.07■■□□□ 1.44
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