RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.71■□□□□ 0.11
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.71■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 BHMT2Q9H2M3 363 aa15.71■□□□□ 0.11
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 TAC1P20366 129 aa15.71■□□□□ 0.11
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAJC19Q96DA6 116 aa15.71■□□□□ 0.11
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KITP10721 976 aa15.69■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MAML1Q92585 1016 aa15.69■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM253P0C7T8 217 aa15.69■□□□□ 0.1
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SERPINB3P29508 390 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 PGM1P36871 562 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEK3P51956 506 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 COG7P83436 770 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 COG2Q14746 738 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPC2Q52LR7 807 aa15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
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