RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 EPC1Q9H2F5 836 aa24.64■■□□□ 1.54
VSTM4-201ENST00000298454 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 LGALS2P05162 132 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK4P31152 587 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2H1P32780 548 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CHMP4BP1P59074 171 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 TEX35Q5T0J7 233 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 JRKLQ9Y4A0 524 aa24.64■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PPTC7Q8NI37 304 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF516Q92618 1163 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 SYT11Q9BT88 431 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 RAB20Q9NX57 234 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0B4J269 797 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 MSCO60682 206 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 GPC3P51654 580 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 IGBP1P78318 339 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL13Q8NEE6 735 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.63■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF286BP0CG31 522 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CLCN3P51790 818 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 KIF22Q14807 665 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD6Q15008 389 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 SEZ6Q53EL9 994 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CHADLQ6NUI6 762 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 METTL13Q8N6R0 699 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA1Q92805 767 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 TINF2Q9BSI4 451 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.62■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC172P0C7W6 258 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 EFNA5P52803 228 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ENPEPQ07075 957 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 INSRRP14616 1297 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 SMPD1P17405 629 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 HELQQ8TDG4 1101 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP4Q96MN2 994 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 FNBP1Q96RU3 617 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF185O15231 689 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN10P78369 228 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ACVR2BQ13705 512 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZPBP2Q6X784 338 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRJQ12913 1337 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 C22orf31O95567 290 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 TNNI1P19237 187 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 USP8P40818 1118 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN3O15551 220 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 NCK2O43639 380 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PALMO75781 387 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PRKCBP05771 671 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK6Q16659 721 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB33Q86T24 672 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 NT5C1BQ96P26 610 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 SNX12Q9UMY4 172 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 FAM170AA1A519 330 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CTAGE8P0CG41 777 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
VSTM4-201ENST00000298454 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.59■■□□□ 1.53
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