RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 FAM228BP0C875 321 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF286BP0CG31 522 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 GJB7Q6PEY0 223 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 SESTD1Q86VW0 696 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 SNX12Q9UMY4 172 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 TGFB1I1O43294 461 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 TACC1O75410 805 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 GNA14O95837 355 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 MYBL2P10244 700 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 DNA2P51530 1060 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 C7orf31Q8N865 590 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 KAT2BQ92831 832 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 TRPC6Q9Y210 931 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.29■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 NRCAMQ92823 1304 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 NR3C1P04150 777 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 SERPING1P05155 500 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 PRKCEQ02156 737 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 PLCB4Q15147 1175 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 TCERG1LQ5VWI1 586 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 MYCT1Q8N699 235 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 BANK1Q8NDB2 785 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 TRIM58Q8NG06 486 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 JRKLQ9Y4A0 524 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 ANO9A1A5B4 782 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 ERICH4A6NGS2 130 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 PJA2O43164 708 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 TBCAO75347 108 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 MS4A14Q96JA4 679 aa15.28■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 PDXKO00764 312 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 KIF20AO95235 890 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 COL6A1P12109 1028 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 KLRC1P26715 233 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 PON1P27169 355 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 ITGA7Q13683 1181 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 CASP8Q14790 479 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.27■□□□□ 0.04
MSMO1-201ENST00000261507 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 MAGEB2O15479 319 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 FAM13AO94988 1023 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 YWHABP31946 246 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 PPFIA1Q13136 1202 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 HDXQ7Z353 690 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 TLR10Q9BXR5 811 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.27■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 CCDC85CA6NKD9 419 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 ARVCFO00192 962 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 GAS2O43903 313 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 ERLIN1O75477 346 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 FTCDO95954 541 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 RFC5P40937 340 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 PTK2Q05397 1052 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 UGCGQ16739 394 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 PTPROQ16827 1216 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 WDR93Q6P2C0 686 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 TRIM50Q86XT4 487 aa15.26■□□□□ 0.03
MSMO1-201ENST00000261507 FIZ1Q96SL8 496 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms