RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258781.10

CCM2-201, Transcript of CCM2 scaffold protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCM2, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2-201ENST00000258781 CCDC172P0C7W6 258 aa30■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 CYP2C19P33261 490 aa30■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 ARHGAP1Q07960 439 aa30■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa30■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa30■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa30■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 TCP11Q8WWU5 503 aa30■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 GABRQQ9UN88 632 aa30■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 IGHA2P01877 340 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 PLCB4Q15147 1175 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 IER5Q5VY09 327 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 MAP7D2Q96T17 732 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 GPR88Q9GZN0 384 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 K7ERI5 159 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 SP3Q02447 781 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 CAPSQ13938 189 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 TRIM50Q86XT4 487 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 ALS2CR12Q96Q35 445 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 TMEM8AQ9HCN3 771 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 MYH10P35580 1976 aa29.99■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 EXTL3O43909 919 aa29.98■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 EVI5O60447 810 aa29.98■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 SLFN12LQ6IEE8 588 aa29.98■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 NENFQ9UMX5 172 aa29.98■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 COQ4Q9Y3A0 265 aa29.98■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 ZBTB42B2RXF5 422 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 ADCY3O60266 1144 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 SMPD1P17405 629 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 MARK3P27448 753 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 LAMC2Q13753 1193 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 NAB2Q15742 525 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 KRT39Q6A163 491 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 JRKLQ9Y4A0 524 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 ZNF233A6NK53 670 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 CCDC127Q96BQ5 260 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 NOX5Q96PH1 765 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa29.97■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 BTNL10A8MVZ5 291 aa29.96■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 MOCS3O95396 460 aa29.96■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 EFNA5P52803 228 aa29.96■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 NAGPAQ9UK23 515 aa29.96■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 SAR1BQ9Y6B6 198 aa29.96■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 ENC1O14682 589 aa29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 GH1P01241 217 aa29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 FLT3LGP49771 235 aa29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 TUBB4BP68371 445 aa29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 PRKCZQ05513 592 aa29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 DUSP28Q4G0W2 176 aa29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 GOLGA1Q92805 767 aa29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 FAM213AQ9BRX8 229 aa29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 BRCA2P51587 3418 aa29.95■■■□□ 2.39
CCM2-201ENST00000258781 HBP1O60381 514 aa29.95■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 KIF22Q14807 665 aa29.95■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 KIAA0753Q2KHM9 967 aa29.95■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 CHMP4BP1P59074 171 aa29.94■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 ARHGEF19Q8IW93 802 aa29.94■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.94■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 SALL4Q9UJQ4 1053 aa29.94■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 LDHAP00338 332 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 GPC3P51654 580 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 DRP2Q13474 957 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 ARHGAP44Q17R89 818 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 SYT11Q9BT88 431 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 CLDN10P78369 228 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 PSMD6Q15008 389 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 IQSEC1Q6DN90 963 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 ZPBP2Q6X784 338 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 TRIB2Q92519 343 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 ERAP1Q9NZ08 941 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 HDAC6Q9UBN7 1215 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 INTUQ9ULD6 942 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 TRPC6Q9Y210 931 aa29.93■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 FBXL13Q8NEE6 735 aa29.92■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 SLC30A5Q8TAD4 765 aa29.92■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 AFG1LQ8WV93 481 aa29.92■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 RABGGTAQ92696 567 aa29.92■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CCM2-201ENST00000258781 CCDC113Q9H0I3 377 aa29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms