RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 RPS6KA5O75582 802 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-201ENST00000256413 MLH1P40692 756 aa16.97■□□□□ 0.31
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CTIF-201ENST00000256413 CYB5R4Q7L1T6 521 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-201ENST00000256413 MAGEB18Q96M61 343 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-201ENST00000256413 RMI1Q9H9A7 625 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-201ENST00000256413 REREQ9P2R6 1566 aa16.97■□□□□ 0.31
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CTIF-201ENST00000256413 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 ANKS1AQ92625 1134 aa16.95■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 GLG1Q92896 1179 aa16.95■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.95■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 BTG4Q9NY30 223 aa16.95■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 GNPATO15228 680 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 PSMC3P17980 439 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 USP11P51784 963 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 GALCP54803 685 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 GREM2Q9H772 168 aa16.94■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.94■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 DUX4L2P0CJ85 424 aa16.94■□□□□ 0.3
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CTIF-201ENST00000256413 DUX4L5P0CJ88 424 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 DUX4L6P0CJ89 424 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 DUX4L7P0CJ90 424 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 MTRQ99707 1265 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 LY9Q9HBG7 655 aa16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CTIF-201ENST00000256413 DUX4Q9UBX2 424 aa16.94■□□□□ 0.3
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