RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 GBP3Q9H0R5 595 aa21.3■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.3■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.29■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 N4BP3O15049 544 aa21.29■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 SKIP12755 728 aa21.29■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 RAB27AP51159 221 aa21.29■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.29■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.29■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 USP20Q9Y2K6 914 aa21.29■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 A0A0U1RQF3 1178 aa21.29■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.29■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 TOP1MTQ969P6 601 aa21.29■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.29■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 BICDL2A1A5D9 508 aa21.28■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.28■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.28■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 STX17P56962 302 aa21.28■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC63Q05C16 580 aa21.28■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.28■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 TTI2Q6NXR4 508 aa21.28■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.27■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.27■■□□□ 1
HOXD11-201ENST00000249504 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.27■■□□□ 1
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HOXD11-201ENST00000249504 FAM189BP81408 668 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD11-201ENST00000249504 NFIL3Q16649 462 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD11-201ENST00000249504 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD11-201ENST00000249504 UBXN11Q5T124 520 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD11-201ENST00000249504 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.26■□□□□ 0.99
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HOXD11-201ENST00000249504 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.26■□□□□ 0.99
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HOXD11-201ENST00000249504 ADSSP30520 456 aa21.25■□□□□ 0.99
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HOXD11-201ENST00000249504 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.25■□□□□ 0.99
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HOXD11-201ENST00000249504 PGBD4Q96DM1 585 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD11-201ENST00000249504 YME1L1Q96TA2 773 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD11-201ENST00000249504 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXD11-201ENST00000249504 TCHPQ9BT92 498 aa21.25■□□□□ 0.99
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