RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4A11Q02928 519 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 VWA3BQ502W6 1294 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM160B1Q5W0V3 765 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CAVIN3Q969G5 261 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 LRWD1Q9UFC0 647 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PP2D1A8MPX8 630 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PAFAH1B1P43034 410 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 APBA1Q02410 837 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA4Q8NEY3 305 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CALML4Q96GE6 196 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB42B2RXF5 422 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB39O15060 712 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2C18P33260 490 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 NOP2P46087 812 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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CAPNS1-201ENST00000246533 MAN2A1Q16706 1144 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DYDC2Q96IM9 177 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC27Q9C0I9 530 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF185O15231 689 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRKCEQ02156 737 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf54Q08AI8 447 aa28.56■■■□□ 2.16
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CAPNS1-201ENST00000246533 SIK3Q9Y2K2 1263 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0355O15063 1070 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF11P52732 1056 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC63Q05C16 580 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 STK4Q13043 487 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP8B4Q8TF62 1192 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OSBPL9Q96SU4 736 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TFR2Q9UP52 801 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SLITRK3O94933 977 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MYBL2P10244 700 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP27A1Q02318 531 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RDM1Q8NG50 284 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 BADQ92934 168 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 NDST4Q9H3R1 872 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DEF6Q9H4E7 631 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 NRCAMQ92823 1304 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF263O14978 683 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 IRAK1P51617 712 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHA7Q15375 998 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC181Q5TID7 509 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 HIPK3Q9H422 1215 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 STIM2Q9P246 746 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP10Q9Y6W6 482 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 EVPLQ92817 2033 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RAG1P15918 1043 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK7P49862 253 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL23P55773 120 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B14Q9BPX1 270 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPS2Q9BXY5 557 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 LTBP2Q14767 1821 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 EBAG9O00559 213 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A2P50443 739 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMD2Q13200 908 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC13DQ70J99 1090 aa28.53■■■□□ 2.16
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CAPNS1-201ENST00000246533 SCLYQ96I15 445 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 LXNQ9BS40 222 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1B10O60218 316 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OATP04181 439 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
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CAPNS1-201ENST00000246533 SKOR1P84550 965 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SERINC5Q86VE9 423 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TPH2Q8IWU9 490 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RUFY1Q96T51 708 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
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CAPNS1-201ENST00000246533 HSF2BPO75031 334 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYND10O75800 440 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMP1P01033 207 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 P4HBP07237 508 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G4FQ68DD2 849 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO5Q75V66 913 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC1Q9BTT6 524 aa28.51■■■□□ 2.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SCN5AQ14524 2016 aa28.51■■■□□ 2.15
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