RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 PRKCEQ02156 737 aa18.49■□□□□ 0.55
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SPCS1-201ENST00000233025 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.49■□□□□ 0.55
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SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
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SPCS1-201ENST00000233025 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.47■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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SPCS1-201ENST00000233025 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.47■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.47■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 GPR62Q9BZJ7 368 aa18.47■□□□□ 0.55
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SPCS1-201ENST00000233025 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.43■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.43■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 NUP205Q92621 2012 aa18.43■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 CACNA1EQ15878 2313 aa18.43■□□□□ 0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ARL5CA6NH57 179 aa18.42■□□□□ 0.54
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