RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Usp15Q8R5H1 981 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Scrn2Q8VCA8 425 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tekt1Q9DAJ2 418 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Eif4e3Q9DBB5 207 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lonp2Q9DBN5 852 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tbx20Q9ES03 445 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Olfr552E9Q545 317 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mroh9G5E8L9 891 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Xirp1O70373 1129 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ZfxP17012 799 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Xrcc5P27641 732 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Muc1Q02496 630 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ZbbxQ0P5X5 716 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Wdr18Q4VBE8 431 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Snx19Q6P4T1 997 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tas2r134Q7TQB0 298 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nacc1Q7TSZ8 514 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mcph1Q7TT79 822 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ttc16Q8C1F5 767 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Commd10Q8JZY2 202 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Spata2Q8K004 515 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pop1Q8K205 1045 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Vmn1r218Q8R261 298 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Chn1Q91V57 459 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pcdha2Q91Y17 948 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ctu1Q99J10 420 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Asb11Q9CQ31 323 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cep72Q9D3R3 646 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 IscuQ9D7P6 168 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 MesdQ9ERE7 224 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prg3Q9JL95 222 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Golga5Q9QYE6 729 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rnf25Q9QZR0 456 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Btbd19S4R1I0 287 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Myh11O08638 1972 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pds5aQ6A026 1332 aa10.06□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fam71aB7XG49 585 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 DgkkE9Q7N4 1118 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 4933406M09RikG3XA12 479 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tnfrsf18O35714 228 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gucy1b3O54865 620 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Phka1P18826 1241 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cetn1P41209 172 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccr1P51675 355 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 DmpkP54265 631 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 AdkP55264 361 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 PrkcbP68404 671 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rtel1Q0VGM9 1203 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Spryd7Q3TFQ1 196 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rhox12Q4TU81 186 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 MmeQ61391 750 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Srd5a1Q68FF9 255 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc87Q8CDL9 855 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Erlin1Q91X78 346 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pcdha9Q91Y11 979 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tcirg1Q9JHF5 834 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Morc1Q9WVL5 950 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rnaseh1O70338 285 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krt35Q497I4 455 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Klra5Q60652 266 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Frmd5Q6P5H6 517 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ints2Q80UK8 1198 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cfap100Q80VN0 613 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 RimklbQ80WS1 387 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Bmp3Q8BHE5 468 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mettl24Q8CCB5 363 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 OgtQ8CGY8 1046 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Celf3Q8CIN6 465 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prmt7Q922X9 692 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Elp3Q9CZX0 547 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 PolkQ9QUG2 852 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Astn1Q61137 1302 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm3127E9Q9P5 263 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm3453K7N724 263 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm6121L7MUF1 212 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cops5O35864 334 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gjc1P28229 396 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Vsnl1P62761 191 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 BC051142Q3V0M8 400 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Arhgap1Q5FWK3 439 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Vav2Q60992 868 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ppp2r5eQ61151 467 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cd180Q62192 661 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ClasrpQ8CFC7 668 aa10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.6 ms