RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019722.11

Ubxn6-201, Transcript of UBX domain-containing protein 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn6, Length 2,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 SpidrQ8BGX7 933 aa11.9□□□□□ -0.5
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Btbd9Q8C726 612 aa11.9□□□□□ -0.5
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Klhl36Q8R124 613 aa11.9□□□□□ -0.5
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Thumpd2Q9CZB3 528 aa11.9□□□□□ -0.5
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sdr42e1Q9D665 394 aa11.9□□□□□ -0.5
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cmtm5Q9D6G9 156 aa11.9□□□□□ -0.5
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Myh14Q6URW6 2000 aa11.9□□□□□ -0.5
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rcn1Q05186 325 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Vav2Q60992 868 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sh3gl3Q62421 347 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CrkQ64010 304 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Krt77Q6IFZ6 572 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fsd1lQ8BYN5 507 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Wdr60Q8C761 999 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zfp449Q8CB76 518 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sumf1Q8R0F3 372 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rpa1Q8VEE4 623 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Usp11Q99K46 921 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cfap53Q9D439 514 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Prss23Q9D6X6 382 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pard6bQ9JK83 371 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Col1a1P11087 1453 aa11.9□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fam47eD3YWC7 402 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Olfr552E9Q545 317 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Kcnk16G5E845 292 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Adam7O35227 789 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ctnnal1O88327 731 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 RpsaP14206 295 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Xrcc5P27641 732 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Palb2Q3U0P1 1104 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 SpdyaQ5IBH7 310 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zdhhc18Q5Y5T2 380 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q8BGC1 442 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Kctd6Q8BNL5 237 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rsad2Q8CBB9 362 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rnf225Q9D7D1 332 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Usp29Q9ES63 869 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tcirg1Q9JHF5 834 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tlr5Q9JLF7 859 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mpp2Q9WV34 552 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Col5a2Q3U962 1497 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Apol7bB1AQP7 369 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Aff1O88573 1216 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 FosP01101 380 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ca8P28651 291 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Adcy7P51829 1099 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cops2P61202 443 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q3UTZ3 580 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Apol7eQ3UZ24 369 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Prr7Q3V0I2 269 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Klra3Q64329 266 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fbxo10Q7TQF2 950 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 PhkbQ7TSH2 1085 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 C2cd2lQ80X80 706 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Trpa1Q8BLA8 1125 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 RbakQ8BQC8 711 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zbtb44Q8R0A2 453 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Uroc1Q8VC12 676 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Med24Q99K74 987 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nsmce1Q9D720 266 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Styxl1Q9DAR2 321 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Smok2bQ9QYZ3 484 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Smok2aQ9QYZ6 504 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Kat6bQ8BRB7 1872 aa11.89□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ets2P15037 468 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 LxnP70202 222 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Adcy8P97490 1249 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ncf1Q09014 390 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cyp11b1Q3TG86 501 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 WlsQ6DID7 541 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ints8Q80V86 995 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tmem117Q8BH18 514 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nemp2Q8CB65 421 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mill1Q8HWE7 395 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Shtn1Q8K2Q9 631 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CrygnQ8VHL5 183 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q99KU6 348 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 MesdQ9ERE7 224 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 IdeQ9JHR7 1019 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Scgb2b21A0A087WQA9 112 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Bpifb9bA2AJD1 591 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm1661E9Q963 441 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm3182K7N6T8 263 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 MyocO70624 490 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fgfr1P16092 822 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Stmn4P63042 189 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pcsk7Q61139 770 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Styk1Q6J9G1 429 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Atp2b4Q6Q477 1205 aa11.88□□□□□ -0.51
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ntrk3Q6VNS1 825 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms