RNA–Protein interactions for RNA: YHR104W

GRE3, Transcript of Aldose reductase, yeast

Gene GRE3, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRE3	YHR104W	SIN3	P22579	1536 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	QCR6	P00127	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	YPT53	P36019	220 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	CDH1	P53197	566 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	PEX30	Q06169	523 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	FDH1	Q08911	376 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	MCT1	Q12283	360 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GRE3	YHR104W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	RPO26	P20435	155 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	PAN1	P32521	1480 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	HEM14	P40012	539 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	PEX31	P53203	462 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	NRM1	P53718	249 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	DPP1	Q05521	289 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	SEC10	Q06245	871 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	VIK1	Q12045	647 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	EFM1	P38732	585 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	PET8	P38921	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	OXA1	P39952	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	COX15	P40086	486 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	RPC17	P47076	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YJR054W	P47114	497 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	HOC1	P47124	396 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	IBA57	P47158	497 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	TPN1	P53099	579 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	MHR1	Q06630	226 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	GET4	Q12125	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	STE18	P18852	110 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	PEX3	P28795	441 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	AEP1	P32493	518 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YKL187C	P34231	750 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	SOL2	P37262	315 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YBR241C	P38142	488 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	BMT2	P38278	337 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	COG7	P53195	279 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YGR015C	P53208	328 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	TPC1	P53257	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	MAL13	P53338	473 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	RNH201	P53942	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	CDC14	Q00684	551 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	ADD37	Q03233	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YML018C	Q03730	393 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YET2	Q04210	160 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	SEY1	Q99287	776 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	VPS15	P22219	1454 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	DAL81	P21657	970 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	QRI5	P32344	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	VAB2	P40003	282 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YRB2	P40517	327 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	DSN1	P40568	576 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	VEL1	P53058	206 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	USE1	P53146	245 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YNR066C	P53752	436 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	ASI3	P53983	676 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YML122C	Q03207	126 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	SCS7	Q03529	384 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	DCR2	Q05924	578 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	STH1	P32597	1359 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	CDC50	P25656	391 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	NAM9	P27929	486 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	SHE1	P38200	338 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	WSC4	P38739	605 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	GLG2	P47011	380 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YGL260W	P53056	76 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	YPS5	P53057	165 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GRE3	YHR104W	SDS23	P53172	527 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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