RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636652.1

CHRNA4-216, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 195 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-216ENST00000636652 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 MYH11P35749 1972 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 A0A1B0GUA9 196 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 NBNO60934 754 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHRNA4-216ENST00000636652 PROZP22891 400 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CD52P31358 61 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CCL23P55773 120 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 STX17P56962 302 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHRNA4-216ENST00000636652 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CHST12Q9NRB3 414 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 PADI3Q9ULW8 664 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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CHRNA4-216ENST00000636652 IKBKBO14920 756 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CLDN3O15551 220 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CXCL10P02778 98 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 NR3C1P04150 777 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 RAG1P15918 1043 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ADSSP30520 456 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHRNA4-216ENST00000636652 MCL1Q07820 350 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 GPNMBQ14956 572 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 SPATA1Q5VX52 437 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CPB2Q96IY4 423 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 MED15Q96RN5 788 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHRNA4-216ENST00000636652 USP20Q9Y2K6 914 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHRNA4-216ENST00000636652 SMTNL1A8MU46 457 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TISP43B9A030 160 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CLIC2O15247 247 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 MCF2P10911 925 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 NR2F2P24468 414 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
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CHRNA4-216ENST00000636652 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 MFSD5Q6N075 450 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM199Q8N511 208 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 SEPT8Q92599 483 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 APBB2Q92870 758 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 SCLYQ96I15 445 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CEP63Q96MT8 703 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.61□□□□□ -0.07
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CHRNA4-216ENST00000636652 CDT1Q9H211 546 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CBX8Q9HC52 389 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 DMAC2Q9NW81 257 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.61□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 BECN2A8MW95 431 aa14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CETN3O15182 167 aa14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 EVI5O60447 810 aa14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 PFKMP08237 780 aa14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ITGB8P26012 769 aa14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 DSC3Q14574 896 aa14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 IQCB1Q15051 598 aa14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.6□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.6□□□□□ -0.07
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