RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	COPS5	Q92905	334 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM63	Q969Q1	353 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ADGRB1	O14514	1584 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	STXBP3	O00186	592 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	AGXT	P21549	392 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CASP5	P51878	434 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TESK1	Q15569	626 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NPNT	Q6UXI9	565 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC103	Q8IW40	242 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8H2	Q8N162	312 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC120	Q96HB5	630 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CERS4	Q9HA82	394 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	EBF1	Q9UH73	591 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	MET	P08581	1390 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PRQ8	180 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KPNA5	O15131	536 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	LCP1	P13796	627 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC9A1	P19634	815 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PDC	P20941	246 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	LSP1	P33241	339 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	MTNR1B	P49286	362 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC38	Q502W7	563 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	USP45	Q70EL2	814 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR18	Q8N4B5	295 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NELL2	Q99435	816 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ALG1	Q9BT22	464 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CBLC	Q9ULV8	474 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	DLC1	Q96QB1	1528 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616		K7ENM7	598 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	DVL2	O14641	736 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFS2	O75306	463 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ALDH2	P05091	517 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	GDNF	P39905	211 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	HK2	P52789	917 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	DUSP4	Q13115	394 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS53	Q5VIR6	699 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP6	Q96JE9	813 aa		5.81	□□□□□ -1.48

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