RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCND2	Q9NZV8	630 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARP2	Q9UGN5	583 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	HES2	Q9Y543	173 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		18.28	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	NR1I2	O75469	434 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	GUCY2C	P25092	1073 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	CA8	P35219	290 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TXLNA	P40222	546 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMTN	P53814	917 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	HYAL1	Q12794	435 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAD1	Q99259	594 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCF25	Q9BQ70	676 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		18.27	■□□□□ 0.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SFI1	A8K8P3	1242 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	GALT	P07902	379 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	BMP1	P13497	986 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	AKAP5	P24588	427 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	MLH1	P40692	756 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPTX2	P47972	431 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRIP1	P48552	1158 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERVFC1	P60507	584 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF39	Q9H2S5	420 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM50B	Q9Y247	325 aa		18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FSD2	A1L4K1	749 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARL5C	A6NH57	179 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFV1	P49821	464 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC12A3	P55017	1021 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRIN1	Q05586	938 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	STRN3	Q13033	797 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	STK38	Q15208	465 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPA	Q15257	358 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		18.25	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PER2	O15055	1255 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDHD2	O94830	711 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLS3	P13797	630 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLCG1	P19174	1290 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	18.24	■□□□□ 0.51	2e-6	■■■□□ 14.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR1G1	P47890	313 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPECC1	Q5M775	1068 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPBP1	Q86WP2	473 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	DAW1	Q8N136	415 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	VPS52	Q8N1B4	723 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGSF21	Q96ID5	467 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP28	Q96RU2	1077 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCHP	Q9BT92	498 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLK14	Q9P0G3	267 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	STK39	Q9UEW8	545 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP20	Q9Y2K6	914 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		18.24	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035		H0YCG3	227 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC16A4	O15374	487 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CXCL14	O95715	111 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC11A1	P49279	550 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCNN1G	P51170	649 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAM15	Q13444	863 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC39A14	Q15043	492 aa		18.23	■□□□□ 0.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		18.23	■□□□□ 0.51

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