RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 FOSBP53539 338 aa24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 CABP7Q86V35 215 aa24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 RNF149Q8NC42 400 aa24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 AUTS2Q8WXX7 1259 aa24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 IGSF21Q96ID5 467 aa24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.54■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 OFD1O75665 1012 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 AOC1P19801 751 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 UBXN11Q5T124 520 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 FLCNQ8NFG4 579 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 SLC22A17Q8WUG5 538 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 PGBD4Q96DM1 585 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.53■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 DMDP11532 3685 aa24.52■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 DGAT1O75907 488 aa24.52■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 PTENP60484 403 aa24.52■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 POU5F1BQ06416 359 aa24.52■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 OTOP3Q7RTS5 596 aa24.52■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.52■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.52■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 STK39Q9UEW8 545 aa24.52■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 DUSP12Q9UNI6 340 aa24.52■■□□□ 1.52
SRRT-218ENST00000620394 POTEMA6NI47 508 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 TXKP42681 527 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 RARRES1P49788 294 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 TDGQ13569 410 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 PTPN14Q15678 1187 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 KANK3Q6NY19 840 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 TMC5Q6UXY8 1006 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 GPR149Q86SP6 731 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 ADSSL1Q8N142 457 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 B4GALT3O60512 393 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 GALTP07902 379 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 ARL2P36404 184 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 ID4P47928 161 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 LONRF3Q496Y0 759 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 CCDC51Q96ER9 411 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 KIF2CQ99661 725 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 RSAD1Q9HA92 442 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.5■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 INPPL1O15357 1258 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 TSPAN1O60635 241 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 ERLIN2O94905 339 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 AXLP30530 894 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 CAPSQ13938 189 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 TFDP1Q14186 410 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 URGCPQ8TCY9 931 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 C8orf76Q96K31 380 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 DNAJB4Q9UDY4 337 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 FBXL21Q9UKT6 434 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa24.49■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 NPR3P17342 541 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 MCM7P33993 719 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 SLC11A1P49279 550 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 ANGPT1Q15389 498 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 AMHR2Q16671 573 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 C8orf34Q49A92 452 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 CNNM3Q8NE01 707 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.48■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 GLRA2P23416 452 aa24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 GUCY1B3Q02153 619 aa24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 NOTUMQ6P988 496 aa24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.47■■□□□ 1.51
SRRT-218ENST00000620394 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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