RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 LCP1P13796 627 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 EFHBQ8N7U6 833 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ACSL3O95573 720 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CUL1Q13616 776 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 RAB42Q8N4Z0 105 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TNIP3Q96KP6 325 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TRPA1O75762 1119 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 EYA4O95677 639 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CTSHP09668 335 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PRR29P0C7W0 189 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CYP2B6P20813 491 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ATG9AQ7Z3C6 839 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SPON2Q9BUD6 331 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 KRT37O76014 449 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 HSPA4LO95757 839 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ESRRGP62508 458 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 IMPG1Q17R60 797 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 E5RI56 91 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TADA2AO75478 443 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CETPP11597 493 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TIPINQ9BVW5 301 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SIK2Q9H0K1 926 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CCDC188H7C350 402 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 KRT7P08729 469 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SREBF2Q12772 1141 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 BARGINQ6ZT62 677 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TADA2BQ86TJ2 420 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 MAML1Q92585 1016 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SPATA17Q96L03 361 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 F5H423 210 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 H3BRJ5 948 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 IER5Q5VY09 327 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 DPEP1P16444 411 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CCT5P48643 541 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ADCY2Q08462 1091 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ZNF543Q08ER8 600 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CCL15Q16663 113 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SH3KBP1Q96B97 665 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 EMSYQ7Z589 1322 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ANP32DO95626 131 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CYBBP04839 570 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 NNTQ13423 1086 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 XKR3Q5GH77 459 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 NCLNQ969V3 563 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 KIF28PB7ZC32 967 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 DFFAO00273 331 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 NDUFB10O96000 172 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 APPL2Q8NEU8 664 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 UPP2O95045 317 aa11.62□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SLC25A27O95847 323 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms