RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP4Q96MN2 994 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF186Q9NXI6 227 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CLDN3O15551 220 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TOM1L1O75674 476 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CYBAP13498 195 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FECHP22830 423 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKCZQ05513 592 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN21Q16825 1174 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 RDH13Q8NBN7 331 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXL18Q96ME1 805 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TCHPQ9BT92 498 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TTYH3Q9C0H2 523 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 GCNT4Q9P109 453 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SRRDQ9UH36 339 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ACKR2O00590 384 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC175P0C221 793 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 AP3M2P53677 418 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 GJA9P57773 515 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PTENP60484 403 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 RAET1EQ8TD07 263 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SPAG5Q96R06 1193 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FNBP1Q96RU3 617 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 HMGCRP04035 888 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CLCN3P51790 818 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT83P78385 493 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 C7orf31Q8N865 590 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MSCO60682 206 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FKTNO75072 461 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MXI1P50539 228 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM187BQ17R55 369 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP7Q8WX94 980 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIB2Q92519 343 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 GABRQQ9UN88 632 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ADSSP30520 456 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP24A1Q07973 514 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MEA1Q16626 185 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 GNASQ5JWF2 1037 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT39Q6A163 491 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 RRAGAQ7L523 313 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 NME8Q8N427 588 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SAAL1Q96ER3 474 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 FZD8Q9H461 694 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 DEF6Q9H4E7 631 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM8AQ9HCN3 771 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SIP14410 1827 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0B4J269 797 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR25O00155 361 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 HAS3O00219 553 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ERLIN2O94905 339 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PON1P27169 355 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CTGFP29279 349 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CHMP4BP1P59074 171 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 NKX3-2P78367 333 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNMA1Q12791 1236 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMD6Q15008 389 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.57■■□□□ 1.52
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