RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO10Q9HD67 2058 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO15AQ9UKN7 3530 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ERLIN2O94905 339 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA4P13612 1032 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MLH1P40692 756 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NBL1P41271 181 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 AK2P54819 239 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TDGQ13569 410 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUD6AQ7L8S5 288 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CNNM3Q8NE01 707 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX27Q96L92 541 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KC1Q96S38 1066 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MTRQ99707 1265 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK12Q9HB15 430 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 HES2Q9Y543 173 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 F8W810 466 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 INPPL1O15357 1258 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX28O15482 410 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ASAP2O43150 1006 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 EFEMP2O95967 443 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NPR3P17342 541 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1G1P47890 313 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CPB2Q96IY4 423 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 GAD1Q99259 594 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 UBN1Q9NPG3 1134 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP12Q9UNI6 340 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 STK36Q9NRP7 1315 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM205CA6NFA0 338 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL5CA6NH57 179 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH6O60337 910 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKL5O76039 1030 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MYBP10242 640 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PTENP60484 403 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 DSC1Q08554 894 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP42Q96MM3 310 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MIOSQ9NXC5 875 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR23AA6NEV1 266 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PI15O43692 258 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ADH1AP07327 375 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GLUD2P49448 558 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SCNN1GP51170 649 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0319Q5VV43 1072 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SLITRK3O94933 977 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 XBP1P17861 261 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 AOC1P19801 751 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 AXLP30530 894 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf16Q68DN1 1984 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NOTUMQ6P988 496 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TPH2Q8IWU9 490 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 APOL6Q9BWW8 343 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CSRNP2Q9H175 543 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NARSO43776 548 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GLUD1P00367 558 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 MBTD1Q05BQ5 628 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP28.55■■■□□ 2.162e-8■■■□□ 17.3
CAPNS1-211ENST00000590874 AMHR2Q16671 573 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMD5Q7Z6J6 570 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SLFN12Q8IYM2 578 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ASAP3Q8TDY4 903 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC51Q96ER9 411 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 RXFP1Q9HBX9 757 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL21Q9UKT6 434 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP54Q96N23 3096 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID2Q68CP9 1835 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 RFPL2O75678 378 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CTDNEP1O95476 244 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 DSG1Q02413 1049 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NR5A1Q13285 461 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPSQ13938 189 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SIX5Q8N196 739 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 RSAD2Q8WXG1 361 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GALT6Q96L58 329 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 IGSF9Q9P2J2 1179 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CLUHO75153 1309 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PFKFB2O60825 505 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TFDP1Q14186 410 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALT5O43286 388 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 BAG4O95429 457 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31D3P0C874 917 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC105Q8IYK2 499 aa28.52■■■□□ 2.16
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