RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 CBFA2T2O43439 604 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPY3P0CV98 308 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPY8P0CW00 308 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 NAT1P18440 290 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 VCAM1P19320 739 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP2C19P33261 490 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 GRIA2P42262 883 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 CCNA1P78396 465 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 GSTM4Q03013 218 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 KLRC3Q07444 240 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 GRIK4Q16099 956 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPN21Q16825 1174 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM240Q5SV17 173 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC6A19Q695T7 634 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 LBX2Q6XYB7 198 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 PCGF5Q86SE9 256 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM13CQ8NE31 585 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC17Q96AE7 1141 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 IGFLR1Q9H665 355 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 INCENPQ9NQS7 918 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 GJD2Q9UKL4 321 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 LAMB1P07942 1786 aa8.84□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXP2O15409 715 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 ORC4O43929 436 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 DLX3O60479 287 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 TTLL1O95922 423 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 CCND1P24385 295 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 MAPK4P31152 587 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 FLT3LGP49771 235 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 ERVK-24P63145 666 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP4K2Q12851 820 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 INAVAQ3KP66 663 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 MB21D1Q8N884 522 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 USP33Q8TEY7 942 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 COG1Q8WTW3 980 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 WHRNQ9P202 907 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 GABRQQ9UN88 632 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 MYPNQ86TC9 1320 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPRFP10586 1907 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPY2A6NKD2 308 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 FANCGO15287 622 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 STRNO43815 780 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF862O60290 1169 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 CLEC3AO75596 197 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 FLOT1O75955 427 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 CHMLP26374 656 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 NT5C2P49902 561 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 UBXN2AP68543 259 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 IL31Q6EBC2 164 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 CPA6Q8N4T0 437 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP95Q96GE4 821 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms