RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TOM1L1	O75674	476 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ERLIN2	O94905	339 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	STRN3	Q13033	797 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CDT1	Q9H211	546 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A0B4J269	797 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR182	O15218	404 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	AXL	P30530	894 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF445	P59923	1031 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	MCL1	Q07820	350 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CEP120	Q8N960	986 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	P2RX5	Q93086	422 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ANK1	P16157	1881 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PDXK	O00764	312 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PSMA7	O14818	248 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	N4BP3	O15049	544 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CCNE1	P24864	410 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	LIG4	P49917	911 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	FPGS	Q05932	587 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PAK1	Q13153	545 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	NFIL3	Q16649	462 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	SEPT8	Q92599	483 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	DPF3	Q92784	378 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	APBB2	Q92870	758 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	BICD1	Q96G01	975 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667		C9IYK1	514 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	NR3C1	P04150	777 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	PFKM	P08237	780 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ACR	P10323	421 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	MCF2	P10911	925 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	PPP1R2	P41236	205 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TTC3	P53804	2025 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ADAM2	Q99965	735 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms