RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 NAPAP54920 295 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 CDK17Q00537 523 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 LRRC63Q05C16 580 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ARID5BQ14865 1188 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ZNF174Q15697 407 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TAF3Q5VWG9 929 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ZNF843Q8N446 348 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 FIBCD1Q8N539 461 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 PDILTQ8N807 584 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TC2NQ8N9U0 490 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 RABGGTAQ92696 567 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 WNT8BQ93098 351 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 EXOC1Q9NV70 894 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 STX8Q9UNK0 236 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ACACAQ13085 2346 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 FLNCQ14315 2725 aa8.89□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PQJ5 194 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 LGALS16A8MUM7 142 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 KCNJ18B7U540 433 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 STK25O00506 426 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 GNA14O95837 355 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TTLL1O95922 423 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 CFHP08603 1231 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 SNHG28P0DPA3 235 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ATP2B1P20020 1258 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 RASA1P20936 1047 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 CDK8P49336 464 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ADCY7P51828 1080 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TDGQ13569 410 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 KCNJ12Q14500 433 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 DUSP6Q16828 381 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA1Q92805 767 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 EPSTI1Q96J88 318 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 NF1P21359 2839 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 CTAGE9A4FU28 777 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 FLOT1O75955 427 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 RETP07949 1114 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 STAT3P40763 770 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TECP42680 631 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 AFMP43652 599 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 GNG11P61952 73 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 AP3B2Q13367 1082 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 BRD3Q15059 726 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 PTGISQ16647 500 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TEX35Q5T0J7 233 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 KRT79Q5XKE5 535 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TSSK4Q6SA08 328 aa8.87□□□□□ -0.99
GGA3-218ENST00000584243 TMEM139Q8IV31 216 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms