RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CHRNA1	P02708	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	AR	P10275	920 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	BMPR1A	P36894	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PDE1A	P54750	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SP4	Q02446	784 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LPIN1	Q14693	890 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CEP120	Q8N960	986 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TTC9	Q92623	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	EDA	Q92838	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TTC14	Q96N46	770 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	OSMR	Q99650	979 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR20	Q99678	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM186A	A6NE01	2351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CYTH3	O43739	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LILRB5	O75023	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CAND2	O75155	1236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	EYA4	O95677	639 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ITGB1	P05556	798 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MARK3	P27448	753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CCND2	P30279	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NDUFV1	P49821	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZXDA	P98168	799 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ADAM15	Q13444	863 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SEC23A	Q15436	765 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ESR2	Q92731	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	APBB2	Q92870	758 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PIGS	Q96S52	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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