RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 PLIN5Q00G26 463 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC173Q0VFZ6 552 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNA2Q15822 529 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC152Q4G0S7 254 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 RILPL1Q5EBL4 403 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SLC10A5Q5PT55 438 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRM-204ENST00000577468 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SWSAP1Q6NVH7 229 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRM-204ENST00000577468 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRM-204ENST00000577468 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRM-204ENST00000577468 SH3GL1Q99961 368 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.864e-6■□□□□ 8
PTPRM-204ENST00000577468 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC113Q9H0I3 377 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TAOK3Q9H2K8 898 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CYP4F11Q9HBI6 524 aa3.44□□□□□ -1.86
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