RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572083.5

CCDC40-206, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-206ENST00000572083 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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CCDC40-206ENST00000572083 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PALB2Q86YC2 1186 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PIDD1Q9HB75 910 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 IPPQ9Y573 584 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 ARL5CA6NH57 179 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 ITGA4P13612 1032 aa22.19■■□□□ 1.14
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CCDC40-206ENST00000572083 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 CEP170P1Q96L14 293 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 RNF39Q9H2S5 420 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 SLC37A4O43826 429 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 EFEMP2O95967 443 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 SP9P0CG40 484 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 DSG1Q02413 1049 aa22.18■■□□□ 1.14
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CCDC40-206ENST00000572083 POTEGQ6S5H5 508 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 NXPE3Q969Y0 559 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 ZFP42Q96MM3 310 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 MBOAT7Q96N66 472 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 GAD1Q99259 594 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 FOXQ1Q9C009 403 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 HES2Q9Y543 173 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 TGM5O43548 720 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 ERLIN2O94905 339 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 LAMP2P13473 410 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 DSC1Q08554 894 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 HTR4Q13639 388 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 DCLK2Q8N568 766 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 RNF149Q8NC42 400 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 CPB2Q96IY4 423 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 APOL6Q9BWW8 343 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 MIOSQ9NXC5 875 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.17■■□□□ 1.14
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CCDC40-206ENST00000572083 COL4A3Q01955 1670 aa22.17■■□□□ 1.14
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CCDC40-206ENST00000572083 POTEMA6NI47 508 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 GLULP15104 373 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 RPS6KB1P23443 525 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 EMC2Q15006 297 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.16■■□□□ 1.14
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CCDC40-206ENST00000572083 CNNM3Q8NE01 707 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 CHST7Q9NS84 486 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 VAV3Q9UKW4 847 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 ARID2Q68CP9 1835 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 M0R2N6 131 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 TSPAN1O60635 241 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 LRRN2O75325 713 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 CDC45O75419 566 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 RFC5P40937 340 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PPP2R5CQ13362 524 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 INF2Q27J81 1249 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 FERMT3Q86UX7 667 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PJA1Q8NG27 643 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 RUBCNQ92622 972 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 CEP250Q9BV73 2442 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CCDC40-206ENST00000572083 ANHXE9PGG2 379 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC40-206ENST00000572083 NR1I2O75469 434 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC40-206ENST00000572083 PAPLNO95428 1278 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC40-206ENST00000572083 NPY5RQ15761 445 aa22.14■■□□□ 1.13
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