RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	LPAR1	Q92633	364 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	HVCN1	Q96D96	273 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	COL20A1	Q9P218	1284 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PNMA2	Q9UL42	364 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GMNC	A6NCL1	334 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	NFIB	O00712	420 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PAEP	P09466	180 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT17	P0C025	328 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	USP8	P40818	1118 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	LIG3	P49916	1009 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	JAK3	P52333	1124 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	SMTN	P53814	917 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K10	Q02779	954 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	19.83	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TISP43	B9A030	160 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TRAPPC3	O43617	180 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	C21orf2	O43822	256 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	RAD17	O75943	681 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CTNNA2	P26232	953 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SEC24C	P53992	1094 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PSMC5	P62195	406 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	USP37	Q86T82	979 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	IL31RA	Q8NI17	732 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD1	Q99460	953 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SFN	P31947	248 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	RASA3	Q14644	834 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	KRT39	Q6A163	491 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SHC3	Q92529	594 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	GLG1	Q92896	1179 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SGPL1	O95470	568 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	COMT	P21964	271 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PEX5	P50542	639 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PMS2	P54278	862 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PEX3	P56589	373 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC169	A6NNP5	214 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	WDR64	B1ANS9	1081 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A4	O15374	487 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CYP1A2	P05177	515 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNB2	P17787	502 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PTGIR	P43119	386 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PLTP	P55058	493 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	MESD	Q14696	234 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	DENND2C	Q68D51	928 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PRELID2	Q8N945	189 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	KRT35	Q92764	455 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	KIFAP3	Q92845	792 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TLCD1	Q96CP7	247 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		19.81	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	ALAS1	P13196	640 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2H1	P32780	548 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	KRT76	Q01546	638 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CD101	Q93033	1021 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	PLVAP	Q9BX97	442 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TRPC6	Q9Y210	931 aa		19.8	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	COPB2	P35606	906 aa		19.79	■□□□□ 0.76
RRN3-205	ENST00000563559	GPC3	P51654	580 aa		19.79	■□□□□ 0.76

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