RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.15■■□□□ 1.14
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RABGGTA-214ENST00000560163 PJA1Q8NG27 643 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-214ENST00000560163 PHKBQ93100 1093 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-214ENST00000560163 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-214ENST00000560163 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-214ENST00000560163 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-214ENST00000560163 CACNA1BQ00975 2339 aa22.14■■□□□ 1.14
RABGGTA-214ENST00000560163 F8W810 466 aa22.14■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 TGM5O43548 720 aa22.13■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.13■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 TBCKQ8TEA7 893 aa22.13■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 FOXQ1Q9C009 403 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 RNF39Q9H2S5 420 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 MIOSQ9NXC5 875 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ARL5CA6NH57 179 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 LRRN2O75325 713 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 TDP2O95551 362 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 OR1G1P47890 313 aa22.12■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 PSMC5P62195 406 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 KRT32Q14532 448 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 PALB2Q86YC2 1186 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 GPR65Q8IYL9 337 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 CNNM3Q8NE01 707 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 HINFPQ9BQA5 517 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ZFHX4Q86UP3 3567 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ITGA4P13612 1032 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 CPA1P15085 419 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 BORCS6Q96GS4 357 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 GAD1Q99259 594 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 PIDD1Q9HB75 910 aa22.11■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 GPC5P78333 572 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 Q6ZUG5 572 aa22.1■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 B3GALT6Q96L58 329 aa22.1■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 M0R2N6 131 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 KINO60870 393 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 KRT37O76014 449 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 IFNAR1P17181 557 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 PARM1Q6UWI2 310 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 SHDQ96IW2 340 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ZFP42Q96MM3 310 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 COL4A3Q01955 1670 aa22.09■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ZMYND10O75800 440 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 MLH1P40692 756 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 SCNN1GP51170 649 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 KCNB2Q92953 911 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.08■■□□□ 1.13
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