RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MIOS	Q9NXC5	875 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GDA	Q9Y2T3	454 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CUTA	O60888	179 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	DGKI	O75912	1065 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	BAIAP3	O94812	1187 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	BMP15	O95972	392 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MYB	P10242	640 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PHKA2	P46019	1235 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FSIP1	Q8NA03	581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PRKCB	P05771	671 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF410	Q86VK4	478 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FIZ1	Q96SL8	496 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC9A7	Q96T83	725 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	RAD9A	Q99638	391 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573		K7ERI5	159 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MLH1	P40692	756 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NUCB2	P80303	420 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GAD1	Q99259	594 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SNTG2	Q9NY99	539 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	IPP	Q9Y573	584 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573		K7ENM7	598 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM13A	O94988	1023 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	DNAJB1	P25685	340 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TXLNA	P40222	546 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SV2B	Q7L1I2	683 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	HASPIN	Q8TF76	798 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	APBB2	Q92870	758 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A0U1RQF3	1178 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1W2PPC1	479 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	PLS3	P13797	630 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	GUCY2C	P25092	1073 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TNFSF9	P41273	254 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	NAMPT	P43490	491 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TFDP1	Q14186	410 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MAPK6	Q16659	721 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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