RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 RNF146Q9NTX7 359 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 TBX20Q9UMR3 447 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PFASO15067 1338 aa22.89■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CNGA1P29973 690 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 MESDQ14696 234 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 WDR64B1ANS9 1081 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 NCKAP1LP55160 1127 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 POTEAQ6S8J7 498 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 JDP2Q8WYK2 163 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 HACL1Q9UJ83 578 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 RGS20O76081 388 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 LYPLA2O95372 231 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC172P0C7W6 258 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 H0YGN5 161 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC188H7C350 402 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 ZBTB7AO95365 584 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CETN1Q12798 172 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 MYBPC2Q14324 1141 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 MICALL2Q8IY33 904 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 TATDN2Q93075 761 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CEP170P1Q96L14 293 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 NFS1Q9Y697 457 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 ZBED4O75132 1171 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 HMGCS2P54868 508 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 GHRHRQ02643 423 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CUL1Q13616 776 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 C18orf8Q96DM3 657 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 NR3C2P08235 984 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 COMTP21964 271 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 ATP8B3O60423 1300 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 NFKBIEO00221 500 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 C2CD6Q53TS8 623 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 FMO1Q01740 532 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF844Q08AG5 666 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 NLRX1Q86UT6 975 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 NR1D1P20393 614 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 GPC5P78333 572 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 ALCAMQ13740 583 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 PIM2Q9P1W9 311 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 MYO1FO00160 1098 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 WNT7BP56706 349 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 SKOR1P84550 965 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 HELQQ8TDG4 1101 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CARD9Q9H257 536 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 JAK3P52333 1124 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 DR1Q01658 176 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 FSTL1Q12841 308 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 SNX24Q9Y343 169 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 SEC24CP53992 1094 aa22.83■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 PTENP60484 403 aa22.83■■□□□ 1.25
TMEM260-216ENST00000557657 KRT76Q01546 638 aa22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms