RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 RPAINQ86UA6 219 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 MAP3K14Q99558 947 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 AAASQ9NRG9 546 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PPC1 479 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SPTLC1O15269 473 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 OFD1O75665 1012 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 STAG3L1P0CL83 205 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ITGA4P13612 1032 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SYT1P21579 422 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ME1P48163 572 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SLC11A1P49279 550 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 DHX58Q96C10 678 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SAAL1Q96ER3 474 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 IPPQ9Y573 584 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 HIP1RO75146 1068 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ALDH2P05091 517 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 CFHP08603 1231 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 BMP1P13497 986 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 JAK3P52333 1124 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 STK38Q15208 465 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ODR4Q5SWX8 454 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 BHMTQ93088 406 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 RSAD1Q9HA92 442 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 COL4A6Q14031 1691 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 C9IYK1 514 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ADAM12O43184 909 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 PRKCBP05771 671 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 LTBRP36941 435 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 TNFSF9P41273 254 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ZNF558Q96NG5 402 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 RIT2Q99578 217 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 DNM3Q9UQ16 869 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 TTC3P53804 2025 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 NRP1O14786 923 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 TBX3O15119 743 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 CCL16O15467 120 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 LRRN2O75325 713 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 RECQL4O94761 1208 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 SMARCA1P28370 1054 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 PDE4CQ08493 712 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 PTPROQ16827 1216 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 IER5LQ5T953 404 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 RASIP1Q5U651 963 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 GPBP1Q86WP2 473 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 USP28Q96RU2 1077 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 LAMB1P07942 1786 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 ARL5CA6NH57 179 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 CLIC2O15247 247 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 CXCL10P02778 98 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 PHKA2P46019 1235 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 RABEP1Q15276 862 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 EPHA7Q15375 998 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 PHOX2BQ99453 314 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 CSRNP2Q9H175 543 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-212ENST00000548567 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.3□□□□□ -1.08
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