RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 EMSYQ7Z589 1322 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 MCM3APO60318 1980 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 BACH1O14867 736 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 LGR5O75473 907 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 TPPPO94811 219 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 EYA4O95677 639 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 PIK3CAP42336 1068 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 PRCPP42785 496 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 CPT1AP50416 773 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 STAT5BP51692 787 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 NKX3-2P78367 333 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 SP4Q02446 784 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 TRIM14Q14142 442 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 ECM1Q16610 540 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 PDXDC1Q6P996 788 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 SV2BQ7L1I2 683 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 TLK2Q86UE8 772 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 RABGGTAQ92696 567 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 RAD54LQ92698 747 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 COPS5Q92905 334 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 VPS16Q9H269 839 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 ZNF302Q9NR11 478 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 ST7Q9NRC1 585 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 ABHD10Q9NUJ1 306 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 KCND2Q9NZV8 630 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 POLG2Q9UHN1 485 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC18-202ENST00000548557 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 POTEFA5A3E0 1075 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KCNJ18B7U540 433 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ADCY6O43306 1168 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ECEL1O95672 775 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 RARBP10826 455 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KCNJ12Q14500 433 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 DGKDQ16760 1214 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 XKR3Q5GH77 459 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TEX35Q5T0J7 233 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 POTEGQ6S5H5 508 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ADSSL1Q8N142 457 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TRPV1Q8NER1 839 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 FAM167AQ96KS9 214 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PLIN2Q99541 437 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 GDAQ9Y2T3 454 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.15□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KPNA6O60684 536 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 INHAP05111 366 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 MMP3P08254 477 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PLA2G4BP0C869 781 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CAPN2P17655 700 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CNGA1P29973 690 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 GJA9P57773 515 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KCNB1Q14721 858 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 BRD3Q15059 726 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KCNK18Q7Z418 384 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 AFG1LQ8WV93 481 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 GLG1Q92896 1179 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CENPTQ96BT3 561 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PARD6BQ9BYG5 372 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms