RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548425.1

APPL2-208, Transcript of adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 2, human

TSL 2

Gene APPL2, Length 428 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APPL2-208	ENST00000548425	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APPL2-208	ENST00000548425	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APPL2-208	ENST00000548425	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APPL2-208	ENST00000548425	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APPL2-208	ENST00000548425	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APPL2-208	ENST00000548425	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APPL2-208	ENST00000548425	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APPL2-208	ENST00000548425	PHF2	O75151	1096 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	GAST	P01350	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	GYPE	P15421	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	COMT	P21964	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	CASR	P41180	1078 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	DUSP2	Q05923	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425		B8ZZF3	427 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	AKR1B10	O60218	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	WAS	P42768	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	MGAT2	Q10469	447 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ACAP2	Q15057	778 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425		Q6ZVL8	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	EDA	Q92838	391 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	PRRG2	O14669	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	NDUFS2	O75306	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ITGA10	O75578	1167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	STC2	O76061	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	C5AR1	P21730	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	CRHR1	P34998	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	GZMK	P49863	264 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	SELENOP	P49908	381 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	NEK2	P51955	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ADAM17	P78536	824 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ODF1	Q14990	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	NCAN	O14594	1321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ZNF20	P17024	532 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	CCND1	P24385	295 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ECHS1	P30084	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	HHEX	Q03014	270 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	SEPT2	Q15019	361 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APPL2-208	ENST00000548425	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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