RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 RPN1P04843 607 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 PLS3P13797 630 aa18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 GLRA2P23416 452 aa18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 CLCN3P51790 818 aa18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 COASYQ13057 564 aa18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.56■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 EP400NLQ6ZTU2 488 aa18.56■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 SPIRE2Q8WWL2 714 aa18.56■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 BSNDQ8WZ55 320 aa18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 FIZ1Q96SL8 496 aa18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 FAM13AO94988 1023 aa18.55■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 LINC00271P0C7V0 271 aa18.55■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 METTL13Q8N6R0 699 aa18.55■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 MAP7D2Q96T17 732 aa18.55■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.55■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 FAM50BQ9Y247 325 aa18.55■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 IDEP14735 1019 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 SCP2P22307 547 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 CDC42EP1Q00587 391 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 PSMD2Q13200 908 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 CAPSQ13938 189 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 PPP2R5AQ15172 486 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 PTPROQ16827 1216 aa18.54■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 SFR1Q86XK3 245 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 TRIML1Q8N9V2 468 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 RMND1Q9NWS8 449 aa18.54■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 LINC01565O15544 149 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 GPC3P51654 580 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 NCKAP1LP55160 1127 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 IKBKEQ14164 716 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ZNF618Q5T7W0 954 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ZNF410Q86VK4 478 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 FBXL6Q8N531 539 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 CCDC155Q8N6L0 562 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 DNAJB3Q8WWF6 145 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 IFT74Q96LB3 600 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 POLD4Q9HCU8 107 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 EXOC1Q9NV70 894 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 MAN1B1Q9UKM7 699 aa18.53■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 FAM186AA6NE01 2351 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 SFI1A8K8P3 1242 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 NPTX2P47972 431 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 PEX3P56589 373 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ZXDAP98168 799 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 MORC3Q14149 939 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 TFDP1Q14186 410 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 COBLL1Q53SF7 1204 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 FAM26DQ5JW98 314 aa18.52■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 ODR4Q5SWX8 454 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 RSPH3Q86UC2 560 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 TMEM192Q8IY95 271 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 MYOCDQ8IZQ8 938 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 MYCT1Q8N699 235 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ASIC4Q96FT7 647 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 STRA6Q9BX79 667 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
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