RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511273.1

CDH18-210, Transcript of cadherin 18, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CDH18, Length 2,318 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-210ENST00000511273 ACTN2P35609 894 aa7.23□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PLCB2Q00722 1185 aa7.23□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 CCINQ13939 588 aa7.23□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.23□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 ARMT1Q9H993 441 aa7.23□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.23□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.23□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 MYH6P13533 1939 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 FRYQ5TBA9 3013 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 TEX28O15482 410 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 CD72P21854 359 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 CDC42EP1Q00587 391 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 RTP5Q14D33 572 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 TMC8Q8IU68 726 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PGBD4Q96DM1 585 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 HCSTQ9UBK5 93 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 ZNF263O14978 683 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SERPINF2P08697 491 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 CD59P13987 128 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 INHBCP55103 352 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 CYP4F3Q08477 520 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 LY6DQ14210 128 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 KCTD1Q719H9 257 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 NAXDQ8IW45 347 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.22□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 AKAP13Q12802 2813 aa7.21□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SNHG28P0DPA3 235 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 WEE1P30291 646 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ASIC1P78348 528 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 AMPD2Q01433 879 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PGM5Q15124 567 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 GPATCH3Q96I76 525 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SEMA3CQ99985 751 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 MAFFQ9ULX9 164 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 FBN3Q75N90 2809 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ZNF623O75123 536 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 FCARP24071 287 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 POLA2Q14181 598 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 NLRX1Q86UT6 975 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 FAM228AQ86W67 206 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SPATA20Q8TB22 786 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SPACA7Q96KW9 195 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.21□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 BPTFQ12830 3046 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ARNTLO00327 626 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SYT13Q7L8C5 426 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 MFSD6LQ8IWD5 586 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 MOCOSQ96EN8 888 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 CRELD1Q96HD1 420 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 CAPN10Q9HC96 672 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 CHST7Q9NS84 486 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms