RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504047.1

ATXN3-208, Transcript of ataxin 3, human

TSL 3

Gene ATXN3, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	AKR1B10	O60218	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	TMEM127	O75204	238 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ITGA10	O75578	1167 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	CASR	P41180	1078 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	APBA1	Q02410	837 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	CDSN	Q15517	529 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	CLUL1	Q15846	466 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ADRM1	Q16186	407 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	GREM2	Q9H772	168 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ECHS1	P30084	290 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CRHR1	P34998	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MTNR1B	P49286	362 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PER3	P56645	1201 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MALL	Q13021	153 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MTMR1	Q13613	665 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	KATNA1	O75449	491 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ENDOD1	O94919	500 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MYBL2	P10244	700 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	OSM	P13725	252 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	AGXT	P21549	392 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ANAPC15	P60006	121 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ACAP2	Q15057	778 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	DOK3	Q7L591	496 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	EXTL1	Q92935	676 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047		B5MCH6	92 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	STC2	O76061	302 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	MT-CO1	P00395	513 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75

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